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Complete mitochondrial genome of the harmful algal bloom species Thalassiosira nordenskioeldii (Mediophyceae, Bacillariophyta) from the east China sea

机译:来自东海的完整的藻类绽放物种Thalassiosira Nordenskioeldii(Mediophyceae,Bacillariophyta)的完全线粒体基因组

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摘要

Thalassiosira nordenskioeldii is a common harmful algal bloom (HAB) species with worldwide distribution. Although barcode sequences of this ecologically important species have been published, no genome data have been published for T. nordenskioeldii . In this study, we constructed the complete mitochondrial genome (mtDNA) of a T. nordenskioeldii strain isolated from the East China Sea. The T. nordenskioeldii mtDNA is circular and has a length of 47,038?bp and a GC content of 30.84%. The mtDNA encodes 69 genes, including 40 protein-coding (PCGs), 27 tRNA and two rRNA genes. Phylogenetic analysis using concatenated amino acid sequences of 31 shared PCGs from 37 diatom mtDNAs revealed that the mtDNA of T. nordenskioeldii was fully resolved in a clade with that of Thalassiosira profunda . The mtDNA of T . nordenskioeldii showed high collinearity with those of T. profunda and Skeletonema marinoi with only minor rearrangements. The completion of Thalassiosira mtDNAs will facilitate evolutionary studies on species of the order Thalassiosirales and the class Mediophyceae.
机译:Thalassiosira Nordenskioeldii是一个常见的有害藻类盛开(HAB)物种,具有全球分布。虽然已经公布了这种生态重要物种的条形码序列,但没有出版任何基因组数据来为 t。 nordenskioeldii。在这项研究中,我们构建了A T的完全线粒体基因组(MTDNA)。从东海隔绝的Nordenskioeldii菌株。 t。 Nordenskioeldii MTDNA是圆形的,长度为47,038磅,GC含量为30.84%。 MTDNA编码69个基因,包括40个蛋白质编码(PCG),27个TRNA和两个RRNA基因。 Phylo到期氨基酸序列的31次硅藻基的31个共用PCG的分析显示, T的MTDNA。 Nordenskioeldii在一个人的思想中完全解决了 Thalassiosira profunda。 t的mtdna。 Nordenskioeldii与 t的相连表现出高的共同性。 Profunda和骨架玛利诺伊只有轻微重排。 Thalassiosira MTDNA的完成将促进关于ThalassioRales阶层的种类和阶级Mediophyceae的进化研究。

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