Se ha documentado que en México 80% de los ecosistemas acuáticos, entre ellos cuerpos de agua como los ríos, se encuentran bajo algún grado de contaminación. Así se ha detectado que los principales contaminantes son materia orgánica, nutrientes (nitrógeno y fósforo) y microorganismos (coliformes fecales). Atender esta problemática es de vital importancia para la conservación de los ecosistemas acuáticos y para mejorar la calidad de vida los pobladores aleda?os. En este sentido la información sobre el estado de calidad de los ecosistemas acuáticos en la cuenca del río Tuxcacuesco, Jalisco es muy escasa e inexistente para sus cuencas tributarias. Por ende, en el presente estudio el objetivo fue inferir la calidad de los ecosistemas acuáticos de dos cuencas tributarias (Tonaya y Apulco) del Río Tuxcacuesco, Jalisco, México mediante la utilización de dos índices. El primero un índice de integridad biótica basado en la presencia o ausencia de familias de macroinvertebrados acuáticos y el segundo un índice para valorar el estado ecológico y la calidad de las riberas fluviales, el índice de calidad de riberas (RQI, por sus siglas en inglés). Se realizaron dos muestreos en cuatro sitios, en el mes de octubre del a?o 2015 (final de la temporada lluviosa) y febrero del a?o 2016 (inicio de la temporada seca), en los cuales se recolectaron macroinvertebrados acuáticos y se aplicó el índice RQI. Además, se evaluaron parámetros fisicos y químicos (pH, conductividad eléctrica y caudal) y se determinó el contenido de nitrógeno total en cada sitio. Mediante un análisis de correspondencia canónica, se evidenció que el caudal y la conductividad eléctrica son las variables ambientales que tienen mayor relación con el ordenamiento de las familias de macroinvertebrados encontradas. En general, el estado ecológico de las riberas es pobre en las dos cuencas tributarias y el contenido de nitrógeno en las aguas rebasa los límites permisibles para uso potable y riego agrícola. En cuanto a la aplicación del índice de integridad biótica se encontró que en la mayoría de los sitios existe presencia de contaminación orgánica.
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