Identification of key genes for type 1 diabetes mellitus by network-based guilt by association

摘要

OBJETIVO: O objetivo deste estudo é realizar uma inferência funcional genética baseada na rede de coexpress?o (CEN), expandindo oescopo do princípio de “Culpa por Associa??o” (GBA - Guilt by Association) para prever as fun??es genéticas do diabetes mellitus tipo1 (T1DM).MéTODOS: Primeiro, os dados transcritos do T1DM foram recuperados do repositório de dados gen?micos para a análise dos genesdiferenciais (DEGs), e foi gerada uma CEN diferencial ponderada. A área sob a curva ROC (AUC) foi escolhida para determinar a métricade desempenho para cada termo de Ontologia Genética (GO). A análise da express?o diferencial identificou 325 DEGs no T1DM, e aanálise de coexpress?o gerou uma CEN diferencial com aresta de peso 0,8.RESULTADOS: Um total de 282 anota??es de GO com DEGs 20 foram mantidas para inferência funcional. Ao calcular a pontua??o demultifuncionalidade dos genes, a inferência da fun??o genética foi realizada para identificar as fun??es genéticas ideais para T1DMcom base na lista de classifica??o genética ideal. Considerando um valor de AUC 0,7, foram identificadas seis fun??es genéticas ideaispara a T1DM, tais como a regula??o do processo imunológico e da atividade dos receptores.CONCLUS?ES: A inferência funcional genética baseada em CEN, ao expandir o princípio de GBA, previu seis fun??es genéticas ideaispara o T1DM. Os resultados podem ser caminhos potenciais para tratamentos terapêuticos ou preventivos do T1DM.