Caracterización genética de bacterias endofíticas de arroz (Oryza sativa L.) con actividad antimicrobiana contra Burkholderia glumae

摘要

El objetivo del presente estudio fue aislar y seleccionar bacterias endofíticas de arroz capaces de inhibir al fitopatógenoBurkholderia glumaeTHT, así como caracterizarlas por su genética y bioquímica. También se buscó caracterizar la diversidad genética y los factores de virulencia presentes en cepas deB. glumaey deBurkholderia gladioli, otro patógeno de arroz, aisladas de campo. Se colectaron plantas de arroz en 4 departamentos del norte de Perú, y tras la desinfección de tejidos se aislaron bacterias endofíticas por cultivo en agar soya tripticasa (30°C; 48h) y en medio selectivo (pH 4,5; 41°C; 72h). Se evaluó la actividad antimicrobiana frente aB. glumaeTHT, la producción de sideróforos y la resistencia a la toxoflavina, toxina producida por este agente. La identificación molecular se realizó mediante BOX-PCR y secuenciación del gen 16S ARNr. Además, se determinó la producción de enzimas extracelulares y se efectuaron ensayos de motilidad y sensibilidad/resistencia a bactericidas. Se aislaron 189 bacterias endofíticas, de las cuales solo 9 presentaron actividad antimicrobiana contraB. glumaeTHT, sobresaliendoBurkholderia vietnamiensisTUR04-01,B. vietnamiensisTUR04-03 yBacillus aryabhattaiAMH12-02. Estas cepas produjeron sideróforos y al menos el 55,5% fueron resistentes a la toxoflavina. Por otro lado, 17 de las cepas deB. glumaeyB. gladioliaisladas se agruparon en 9 perfiles BOX-PCR, 16 de ellas presentaron similitud conB. glumaeLMG2196T(100%) y una conB. gladioliNBRC13700T(99,86%). Hubo elevada diversidad de acuerdo al origen geográfico y se encontraron factores de virulencia. En conclusión, se hallaron cepas del géneroBacillusyBurkholderiaque podrían ser agentes de biocontrol contraB. glumae.