Secuenciación de nueva generación del viroma del maní forrajero (Arachis pintoi)

摘要

El maní forrajero (Arachis pintoi) es uno los cultivos forrajeros mejor adaptado a los agroecosistemas tropicales, donde se utiliza en mezclas con gramíneas para alimentación animal, como alternativa para la cobertura del suelo en áreas urbanas y talúdes y para la conservación de suelos en plantaciones de palma africana, café y cítricos. Aunque el maní forrajero se considera una planta tolerante a plagas y enfermedades, en los últimos a?os se ha observado en Colombia el aumento de síntomas asociados a enfermedades virales. Con el objeto de evaluar la ocurrencia de virus en dichos materiales sintomáticos, en el presente estudio se utilizó la metodología de Secuenciación de Nueva Generación (NGS) del transcriptoma de un grupo de muestras de A. pintoi procedentes de zonas urbanas en Medellín (Colombia). Los resultados indicaron la presencia de 3.291.089 reads asociados a genomas virales de miembros de las familias Potyviridae, Luteoviridae y Alphaflexiviridae; siendo posible obtener los genomas completos del Peanut mottle virus (9707 nt), Turnip yellows virus (5578 nt) y de dos variantes de un virus filogenéticamente relacionado con el género Allexivirus. Estas dos variantes carecen del ORF6 presente en Allexivirus, por lo que posiblemente se trata de miembros de un género hasta ahora no caracterizado en la familia Alphaflexiviridae. La ocurrencia de al menos tres virus que infectan plantas de A. pintoi en Colombia, llama la atención sobre la necesidad de emprender un trabajo de limpieza de germoplasma en el material de siembra utilizado para el establecimiento de este forraje tropical.