Experience in developing graphical user interface to R programming language for clinical and experimental data analysis

摘要

Цель. Разработка программного продукта для анализа медицинских данных и представления показателей здравоохранения. Методы. Разработана программа R_MED - интерфейс для решения некоторых типовых задач анализа экспериментальных, клинико-лабораторных и эпидемиологических данных с использованием возможностей системы R. Результаты. Функционально программа состоит из следующих блоков: ?Загрузка данных?, ?Настройка?, ?Базовый расчёт?, ?Data Mining?, ?Представление показателей здравоохранения?. Упрощение интерфейса достигается также включением в программу только тех методов анализа данных, которые наиболее часто необходимы при анализе медицинских данных. Так, в ?Базовый расчёт? включены следующие процедуры статистического анализа: описательные статистики для количественных переменных, таблицы частот, гистограммы и бокс-графики, корреляционная матрица эллипсов (Пирсон), количественные корреляции Пирсона, порядковые корреляции Спирмена, корреляционная матрица эллипсов (Спирмен), диаграммы рассеяния на плоскости, определение различий в двух независимых групповых выборках с применением критериев Стьюдента и Манна-Уитни, дисперсионный анализ ANOVA. В ?Настройке? пользователь может выбрать для анализа набор переменных и наблюдений, изменить набор свойств любой переменной, добавить, удалить, переименовать переменную, а также опционально настроить режим загрузки данных, базового расчёта и вывода. В программе предусмотрена возможность визуализации данных с помощью блока ?Представление показателей здравоохранения? в разрезе ?территория?, ?год?, ?показатель?. Территориальные разрезы могут дифференцироваться по трём уровням: муниципальный, субъектовый, окружной (федеральный округ). Для построения карт в системе R_MED хранятся векторные данные по всем трём территориальным уровням, включая федеральные округи Российской Федерации. ВЫВОД. Первоначально разработанная для решения исследовательских задач по прогнозированию риска развития патологии программа R_MED при соответствующей настройке также может быть использована в других клинико-диагностических и эпидемиологических исследованиях с целью мониторирования социально значимых заболеваний и деятельности служб здравоохранения, а также при подготовке годовых статистических отчётов, вплоть до уровня региона.