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Cross-sectional surveillance of Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) in dromedary camels and other mammals in Egypt, August 2015 to January 2016

机译：2015年8月至2016年1月在埃及的骆驼和其他哺乳动物中进行中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）横断面监测

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A cross-sectional study was conducted in Egypt to determine the prevalence of Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) in imported and resident camels and bats, as well as to assess possible transmission of the virus to domestic ruminants and equines. A total of 1,031 sera, 1,078 nasal swabs, 13 rectal swabs, and 38 milk samples were collected from 1,078 camels in different types of sites. In addition, 145 domestic animals and 109 bats were sampled. Overall, of 1,031 serologically-tested camels, 871 (84.5%) had MERS-CoV neutralising antibodies. Seroprevalence was significantly higher in imported (614/692; 88.7%) than resident camels (257/339; 5.8%) (p?
机译：在埃及进行了一项横断面研究，以确定中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）在进口和居住的骆驼和蝙蝠中的患病率，并评估该病毒可能向国内反刍动物和马传播。从不同地点的1,078头骆驼中总共采集了1,031血清，1,078鼻拭子，13直肠拭子和38牛奶样品。此外，还采样了145只家畜和109只蝙蝠。总体而言，在1,031份经血清学测试的骆驼中，有871（84.5％）人具有MERS-CoV中和抗体。进口的血清阳性率（614/692; 88.7％）显着高于当地的骆驼（257/339; 5.8％）（p <0.05）。来自苏丹的骆驼（543/594; 91.4％）的血清阳性率高于来自东非的骆驼（71/98; 72.4％）（p <0.05）。采样部位和年龄也与MERS-CoV血清阳性率相关（p <0.05）。来自家畜和蝙蝠的所有测试样品的MERS-CoV抗体均为阴性，除了一只羊样品的效价为1：640。在1,078头骆驼中，MERS-CoV遗传物质中有41例（3.8％）呈阳性。没有发现获得的序列与进化枝A或B MERS-CoV序列聚类，并且在遗传上是多样的。一只绵羊与血清阳性骆驼接触时，中和抗体的存在要求对与骆驼接触的家畜进行进一步研究。关键字：MERS-CoV，骆驼，反刍动物，马，蝙蝠，埃及简介自沙特阿拉伯首例人类呼吸道综合症冠状病毒（MERS-CoV）人类病例以来，2012年，世界卫生组织（WHO）收到了1,698个实验室的通知，截至2016年3月，已确认来自26个国家的人间确诊病例和至少609人死亡[1]。原发性感染起源于阿拉伯半岛内的国家，但其他国家也报告了与旅行有关的病例以及一些继发性和医院传播。 2016年的一项最新研究在肯尼亚的人血清中发现了针对MERS-CoV的抗体[2]。血清学和分子研究的可用数据表明，阿拉伯半岛许多人的MERS-CoV感染的主要来源似乎是单峰骆驼[3-5]。蝙蝠还起源于许多已知的哺乳动物冠状病毒的起源，包括严重的急性呼吸综合症（SARS）[6,7]。 MERS-CoV基因组序列与蝙蝠冠状病毒序列的密切关系表明，蝙蝠可能是MERS-CoV的宿主[8]。此外，蝙蝠细胞系显示出MERS-CoV特异性受体二肽基肽酶4（DPP4），可以在实验条件下被感染[9]。先前的流行病学研究旨在研究蝙蝠中MERS-CoV的存在，发现蝙蝠粪便样品产生的特征序列与先前表征的MERS-CoV序列之间存在密切的关系[10-12]。在1983年至1997年期间，对来自主要骆驼出口国苏丹和索马里的189个已存档单峰骆驼血清进行了回顾性血清学研究，结果表明，在81％的总样本中存在MERS-CoV中和抗体，表明长期存在骆驼之间的MERS-CoV循环[13]。来自非洲国家（埃及，埃塞俄比亚，肯尼亚，尼日利亚，苏丹和突尼斯）和阿拉伯半岛（约旦，阿曼，卡塔尔，沙特阿拉伯和阿拉伯联合酋长国）的独角兽具有较高的MERS-CoV抗体血清阳性率[14-20 ]。单峰骆驼是中东国家数百万人食用骆驼奶和肉的文化的一部分。在中东交易的大多数单峰骆驼都在东非国家繁殖，主要在埃塞俄比亚，肯尼亚，索马里和苏丹[21]。在过去的5至6年（2010年至2015年）中，有超过120万头骆驼进口到埃及，其中近70％从苏丹进口，其余从非洲之角进口，主要是埃塞俄比亚[22]。对埃及的骆驼进行了血清学调查，揭示了针对MERS-CoV的高水平抗体[17,23]。此外，在该国从屠宰场收集的标本中通过病毒学检测发现了MERS-CoV [23]。这项研究的目的是确定在进口和栖息的骆驼中MERS-CoV的流行情况，并调查埃及其他家畜中的病毒流行程度。方法研究动物和采样策略收集了总共1176份血清和1223支鼻拭子1,223只动物，其中包括1,078只单峰骆驼（居住在当地的339只，进口的739只）和145种其他家畜（牛，n == 35;绵羊，n == 51;山羊，n == 36;驴，n == 15）在2015年8月至2016年1月之间，分别来自埃及七个省（图1）的不同采样点（检疫站，活体动物市场，屠宰场和村庄）的水牛和马（每只n = 4）。在单独的窗口中打开图1站点2015年8月至2016年1月在埃及从单峰骆驼和家畜中采集的样本的图（n = 1,223只动物〜（a））〜（a）除1078只骆驼外。共145只家畜

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