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【24h】

Transcriptome response to heat stress in a chicken hepatocellular carcinoma cell line

机译:鸡肝细胞癌细胞系中转录组对热应激的反应

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摘要

Heat stress triggers an evolutionarily conserved set of responses in cells. The transcriptome responds to hyperthermia by altering expression of genes to adapt the cell or organism to survive the heat challenge. RNA-seq technology allows rapid identification of environmentally responsive genes on a large scale. In this study, we have used RNA-seq to identify heat stress responsive genes in the chicken male white leghorn hepatocellular (LMH) cell line. The transcripts of 812 genes were responsive to heat stress (p?
机译:热应激会触发细胞中一组进化上保守的反应。转录组通过改变基因表达使细胞或有机体适应热挑战,从而对体温过高做出反应。 RNA-seq技术可以快速识别大规模的环境响应基因。在这项研究中,我们已使用RNA-seq鉴定了鸡雄性白色来亨鸡肝细胞(LMH)细胞系中的热应激反应基因。 812个基因的转录本对热胁迫有反应(p 0.01),其中2.5个h的时间后有235个基因上调和577个基因被下调。在上调的基因中,其产物起分子伴侣的作用,以及影响胶原合成和沉积,转录因子,染色质重塑剂的基因,以及调节WNT和TGF-β途径的基因。在被下调的基因中主要是影响DNA复制和修复以及染色体分离的基因。这项研究中鉴定的许多基因以前并未涉及热应激反应。这些数据扩展了我们对转录组对热应激反应的理解,其中有许多已确定的生物学过程和途径可能有助于使细胞和生物适应高温应激。此外,这项研究应为未来尝试通过全基因组关联研究和育种提高物种抵抗热胁迫的能力提供重要见识。

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