Etude de la contamination microbienne des myes (Mya arenaria) de la rive nord de l'estuaire maritime du fleuve Saint-Laurent (QuEbec, Canada)

摘要

The aims of the present study were to assess the microbial quality of Mya arenaria clams from the north shore of the St. Lawrence River estuary and to validate various microbial indicator microorganisms of bivalve mollusks contamination. Clams were collected from nine sites, including four harvesting sites closed by virtue of the Canadian Shellfish Sanitation Program (CSSP). Six contamination indicators (fecal coliforms, somatic coliphages, F-specific coliphages, fecal streptococci, Clostridium perfringens, and Escherichia coli) and four pathogens (Campylobacter sp., Cryptosporidium parvum, Giardia sp., and Salmonella sp.) were identified in the clams. Indicators sensibility, specificity and predictive values with respect to the presence of pathogens were calculated. Pathogenic microorganisms detection frequency in clams was important (92%). Globally, pathogens tend to be less frequently detected in opened harvesting sites (p = 0.086). Although the assessed indicators were not perfect, when F-specific coliphages are associated with E. coli or fecal coliforms, a good sensibility (62%-64%) and good positive predictive value (88%) with respect to the investigated pathogens are obtained.Key words: mollusks, coliforms, Giardia, Cryptosporidium, Campylobacter.[Journal translation]Les objectifs de la présente étude étaient d'évaluer la qualité microbienne des myes (Mya arenaria) sur la rive nord de l'estuaire maritime du fleuve Saint-Laurent et de vérifier la validité de divers microorganismes indicateurs de la contamination microbienne des mollusques bivalves. Les myes ont été collectées dans neuf sites dont quatre étaient fermés à la cueillette en vertu du Programme canadien de contrôle de la salubrité des mollusques. Six indicateurs (coliformes fécaux, coliphages somatiques, coliphages F-spécifiques, streptocoques fécaux, Clostridium perfringens et Escherichia coli) et quatre pathogènes (Campylobacter sp., Crytosporidium parvum, Giardia sp. et Salmonella sp.) ont été identifiés dans les myes. La sensibilité, la spécificité, et les valeurs prédictives des indicateurs en fonction de la présence des pathogènes ont été calculées. La fréquence de détection des microorganismes pathogènes dans les myes était importante (92 %). Globalement les pathogènes ont tendance à être moins fréquemment mis en évidence dans les secteurs ouverts à la cueillette (p = 0,086). Même si les indicateurs étudiés sont imparfaits, en associant les coliphages F-spécifiques aux E. coli ou aux coliformes fécaux, on obtient une bonne sensibilité (62 % à 64 %) et une bonne valeur prédictive positive (88 %) en relation avec les pathogènes investigués.Mots clés : mollusques, coliforme, Giardia, Cryptosporidium, Campylobacter.