A comparative study of endophytic fungi in needles, bark, and xylem of Pinus tabulaeformis

摘要

Endophytic fungi associated with Chinese oil pine (Pinus tabulaeformis Carr.) from two distinct climatic sites, Fenghuangshan and Lingyuan in northeast China, were investigated. A total of 2065 fungal isolates were recovered from 4320 tissue segments consisting of needles, bark, and xylem from 30 mature trees for each site. Twenty-one fungal taxa were identified; the remaining 205 isolates (11% of total isolates) did not sporulate and could not be identified. There were higher overall colonization and isolation rates of endophytic fungi from the Fenghuangshan than from the Lingyuan site. At the Fenghuangshan site, the colonization and isolation rates significantly increased with the age of the needles and xylem, but not of the bark. At the Lingyuan site, the colonization and isolation rates significantly increased with the age of the xylem; however, there were no significant differences between 2- and 3-year-old needles and bark, except that they both contained fewer endophytes in 1-year-old by comparison with 2- and 3-year-old needles and bark. Alternaria alternata (Fr.) Keissler, Phoma sp.1, Phomopsis archeri B.C. Sutton, and Leptostroma sp. were the dominant taxa in the bark and needles. There was a high Sorenson's coefficient (0.89) of endophyte composition similarity between the Fenghuangshan and Lingyuan sites. We conclude that some fungi show a degree of tissue recurrence or specificity and that the composition of endophyte assemblages is not greatly influenced by geographical or climatic factors.Les auteurs ont examiné les champignons endophytes associés au pin à huile de Chine (Pinus tabulaeformis Carr.) provenant de deux régions climatiques, i.e., Fenghuangshan et Lingyuan, du nord de la Chine. Ils sont récupéré 2065 isolats fongiques à partir de 4320 segments de tissus, constitués d'aiguilles, d'écorce et de xylème, prélevés sur 30 arbres matures pour chacun des sites. Ils ont identifié 21 taxons fongiques et les 205 isolats résiduels (11 % du total des isolats) n'ont pas sporulé, et n'ont pu être identifiés. Dans l'ensemble, on observe une colonisation et des taux d'isolation plus importants sur le site de Fenghuangshan que celui de Lingyuan. Sur le site de Fenghuangshan, les taux de colonisation et d'isolation augmentent significativement avec l'âge des aiguilles et du xylème, mais non celui de l'écorce. Sur le site de Lingyuan, les taux de colonisation et d'isolation augmentent significativement avec l'âge du xylème; cependant on observe aucune différence significative entre les aiguilles de 2-3 ans et l'écorce, sauf que les deux possèdent moins d'endophytes chez les aiguilles et l'écorce d'un an, comparativement aux aiguilles de 2-3 ans et l'écorce. Les taxons dominants, dans l'écorce et les aiguilles, comprennent Alternaria alternaria (Fr.) keissler, Phoma sp.1, Phomopsis archeri B.C. Sutton, et Leptostroma sp. Le coefficient de similarité de Sorenson, pour la similarité des sites, est élevé (0,89) entre les deux sites de Fenghuangshan et Lingyuan. On conclut que certains champignons montrent un fort degré de récurrence dans les tissus et que la spécificité et la composition de l'ensemble des endophytes ne sont pas très influencées par les facteurs géographiques ou climatiques.