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The MEMPACK alpha-helical transmembrane protein structure prediction server

机译:MEMPACKα-螺旋跨膜蛋白结构预测服务器

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摘要

Motivation: The experimental difficulties of alpha-helical transmembrane protein structure determination make this class of protein an important target for sequence-based structure prediction tools. The MEMPACK prediction server allows users to submit a transmembrane protein sequence and returns transmembrane topology, lipid exposure, residue contacts, helix–helix interactions and helical packing arrangement predictions in both plain text and graphical formats using a number of novel machine learning-based algorithms.
机译:动机:α-螺旋跨膜蛋白结构测定的实验困难使此类蛋白成为基于序列的结构预测工具的重要目标。 MEMPACK预测服务器允许用户使用多种基于机器学习的新颖算法,以纯文本和图形格式提交跨膜蛋白序列,并以纯文本和图形格式返回跨膜拓扑,脂质暴露,残基接触,螺旋-螺旋相互作用和螺旋堆积安排预测。

著录项

  • 来源
    《Bioinformatics》 |2011年第10期|p.1438-1439|共2页
  • 作者

    David T. Jones;

  • 作者单位
  • 收录信息 美国《科学引文索引》(SCI);美国《化学文摘》(CA);
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类
  • 关键词

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