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Identification and characterization of DSPIa a novel isoform of human desmoplakin

机译:DSPIa的鉴定和表征DSPIa是人桥粒铂的新型同种型

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摘要

Desmoplakin is a ubiquitous component of desmosomes and desmosome-like structures, such as the cardiomyocyte area composita. Two major isoforms, desmoplakin I (DSPI) and desmoplakin II (DSPII) are encoded by alternative mRNA transcripts differentially spliced from the same gene. The resulting proteins are identical in amino acid sequence with the exception that DSPII contains only one third of the central alpha-helical rod domain present in DSPI. Here we describe a novel minor isoform of desmoplakin that is also produced by alternative splicing of the desmoplakin gene and that we name desmoplakin Ia (DSPIa). DSPIa is an alternatively spliced DSPI mRNA with a unique splice donor site that is 90% homologous to and downstream of the DSPII specific donor. The resulting DSPIa mRNA is in-frame and encodes a protein that has a central alpha-helical rod domain of intermediate size and that is 156 amino acids larger than DSPII and 443 amino acids smaller than DSPI. We demonstrate, through recombinant expression and short interfering RNA knockdown, that the DSPIa protein is readily detectable, albeit at substantially lower levels than the dominant isoforms, DSPI and DSPII. DSPIa mRNA has a similar tissue distribution to that of DSPI and of DSPII.Electronic supplementary materialThe online version of this article (doi:10.1007/s00441-010-0989-1) contains supplementary material, which is available to authorized users.
机译:桥粒铂是桥粒和桥粒样结构(例如心肌细胞区域复合物)的普遍成分。两种主要的亚型,desmoplakin I(DSPI)和desmoplakin II(DSPII)由从同一基因差异剪接的替代mRNA转录本编码。所得蛋白质的氨基酸序列相同,不同之处在于DSPII仅包含DSPI中存在的中央α-螺旋杆结构域的三分之一。在这里,我们描述了desmoplakin的新型次要亚型,它也通过desmoplakin基因的选择性剪接产生,我们将其命名为desmoplakin Ia(DSPIa)。 DSPIa是具有独特剪接供体位点的选择性剪接DSPI mRNA,其与DSPII特异性供体及其下游90%同源。产生的DSPIa mRNA符合读框,并编码一种蛋白质,该蛋白质具有中等大小的中央α-螺旋杆结构域,比DSPII大156个氨基酸,比DSPI小443个氨基酸。通过重组表达和短干扰RNA敲低,我们证明了DSPIa蛋白很容易被检测到,尽管其水平明显低于优势同工型,DSPI和DSPII。 DSPIa mRNA具有与DSPI和DSPII类似的组织分布。电子补充材料本文的在线版本(doi:10.1007 / s00441-010-0989-1)包含补充材料,授权用户可以使用。

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