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Total Wiring Length Minimization of C. elegans Neural Network: A Constrained Optimization Approach

机译:线虫神经网络的总布线长度最小化:一种约束优化方法

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摘要

Using the most recent data on the connectivity of the C. elegans neural network, we find optimal two-dimensional positions of interneurons that minimize the total wiring length provided that the positions of motor and sensory neurons are fixed. The rationale behind fixing motor and sensory neurons is the following: while positions of motor and sensory neurons can be influenced by the locations of muscles and sensory organs they are attached to, the main function of interneurons is to connect other neurons, and their placement could try to minimize the wiring length. Solutions for l 1, l 2 and squared l 2–norm were obtained. For the Euclidean norm l 2, the relative and absolute difference between the real and optimal total wiring lengths is minimal among these functions of distance. Additional network constraints were discussed such as assignment of different weights to electrical or chemical connections, fixation of “tail” interneurons, minimal interneural distance limitation, and others. These constraints were compared by their influence on the optimal positions of interneurons.
机译:使用关于秀丽隐杆线虫神经网络连通性的最新数据,我们发现中间神经元的最佳二维位置可以最大限度地减小总接线长度,前提是运动神经和感觉神经元的位置是固定的。固定运动神经和感觉神经元的基本原理如下:尽管运动神经和感觉神经元的位置会受到它们所附着的肌肉和感觉器官的位置的影响,但中间神经元的主要功能是连接其他神经元,并且它们的位置可以尽量减少接线长度。获得l 1 ,l 2 和平方l 2 -范数的解。对于欧几里得范数l 2 ,在这些距离函数中,实际和最佳总布线长度之间的相对和绝对差最小。讨论了其他网络约束,例如将不同的权重分配给电气或化学连接,固定“尾”中间神经元,最小神经间距离限制等。通过比较它们对中间神经元最佳位置的影响来比较这些约束。

著录项

  • 期刊名称 PLoS Clinical Trials
  • 作者

    Andrey Gushchin; Ao Tang;

  • 作者单位
  • 年(卷),期 2010(10),12
  • 年度 2010
  • 页码 e0145029
  • 总页数 16
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种
  • 中图分类
  • 关键词

  • 入库时间 2022-08-17 12:35:30

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