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The complete chloroplast genome of Eclipta prostrata L. (Asteraceae)

机译:Eclipta Prostrata L.的完整叶绿体基因组。(Asteraceae)

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摘要

Eclipta prostrata is an herbal medicinal plant belonging to the Asteraceae family. In this study, complete chloroplast genome sequence of the E. prostrata was characterized by de novo assembly using whole genome sequence data. The genome of E. prostrata was 151,757 bp in length, which was composed of large single copy region of 83,285 bp, small single copy region of 18,346 bp and a pair of inverted repeat regions of 25,063 bp. The genome harboured 80 protein coding sequences, 30 tRNA genes and 4 rRNA genes. We confirmed close taxonomic relationship between E. prostrata and Helianthus annuus through phylogenetic analysis with chloroplast protein-coding genes.
机译:Eclipta Prostrata是一种属于菊科家族的草药植物。在该研究中,通过使用全基因组序列数据的De Novo组装,完全叶绿体基因组序列的特征。 E. Prostrata的基因组长度为151,757bp,由大型单拷贝区域的83,285bp,小单拷贝区域为18,346 bp,一对倒置重复区域为25,063 bp。基因组靶向80个蛋白质编码序列,30个TRNA基因和4 rRNA基因。通过用叶绿体蛋白编码基因来确认通过系统发育分析来确认E. Prostrata和Helianthus Annuus之间的分类学关系。

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