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Complete plastome sequence of Rumex japonicus (Polygonaceae) in Dok-do Island Korea

机译:韩国Dok-Do岛的Rumex japonicus(Polygonaceae)的完全塑料序列

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摘要

We reported the complete chloroplast genome sequence of Rumex japonicus in Dok-do Island, Korea. The genome size was 159,223 bp in total length with one large single-copy (LSC; 84,962 bp), one small single-copy (SSC; 12,999 bp), and 2 inverted repeat (IR) regions (IRa and IRb, each with 30,631 bp). The overall GC content was 37.5% and the genome contained 131 genes, including 83 protein-coding, 38 transfer RNA and 8 ribosomal RNA genes. Phylogenetic analysis supported monophyly of subgenus Rumex and determined the phylogenetic position of R. japonicus as sister to the clade containing R. crispus and R. nepalensis.
机译:我们报道了韩国商业湾岛葡萄酒粳稻的完全叶绿体基因组序列。总长度的基因组大小为159,223bp,一个大单拷贝(LSC; 84,962bp),一个小单拷贝(SSC; 12,999 BP),2个倒置重复(IR)区域(IRA和IRB,每个倒置(IRA和IRB),每个倒置(IRA和IRB),每次有30,631个BP)。总GC含量为37.5%,基因组含有131个基因,包括83个蛋白质编码,38转移RNA和8个核糖体RNA基因。系统发育分析支持亚rumex的单层,并确定了R. japonicus的系统发育位置,作为含有R. crispus和R. nepalensis的思考。

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