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EC-BLAST: A Tool to Automatically Search and Compare Enzyme Reactions

机译:EC-BLAST:自动搜索和比较酶反应的工具

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摘要

EC-BLAST is an algorithm for quantitative similarity searches between enzyme reactions at three levels a) bond change, b) reaction centre and c) reaction structure similarity. It exploits the knowledge of bond changes and reaction patterns for all known biochemical reactions derived from atom-atom mapping (AAM) across each reaction. This has the potential to improve the established enzyme classification system, to find novel biochemical transformations, to improve the assignment of enzyme function to sequences, as well as for the re-engineering of enzymes.EC-BLAST URL:
机译:EC-BLAST是一种算法,用于在三个级别的酶反应之间进行定量相似性搜索:a)键变化,b)反应中心和c)反应结构相似性。它利用从每个反应中的原子-原子映射(AAM)派生的所有已知生化反应的键变化和反应模式的知识。这可能会改善已建立的酶分类系统,发现新的生化转化,改善酶功能对序列的分配以及酶的重新设计.EC-BLAST URL:

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