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Pergola-web: a web server for the visualization and analysis of longitudinal behavioral data using repurposed genomics tools and standards

机译:Pergola-web:使用重新设计的基因组学工具和标准对纵向行为数据进行可视化和分析的Web服务器

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摘要

We present a new web application to query and visualize time-series behavioral data: the Pergola web-server. This server provides a user-friendly interface for exploring longitudinal behavioral data taking advantage of the Pergola Python library. Using the server, users can process the data applying some basic operations, such as binning or grouping, while formatting the data into existing genomic formats. Thanks to this repurposing of genomics standards, the application automatically renders an interactive data visualization based on sophisticated genome visualization tools. Our tool allows behavioral scientists to share, display and navigate complex behavioral data comprising multiple individuals and multiple data types, in a scalable and flexible manner. A download option allows for further analysis using genomic tools. The server can be a great resource for the field in a time where behavioral science is entering a data-intensive cycle thanks to high-throughput behavioral phenotyping platforms. Pergola is publicly available at .
机译:我们提供了一个新的Web应用程序来查询和可视化时间序列行为数据:Pergola Web服务器。该服务器提供了一个用户友好的界面,用于利用Pergola Python库浏览纵向行为数据。使用服务器,用户可以在将数据格式化为现有基因组格式的同时,应用一些基本操作(例如,合并或分组)来处理数据。由于基因组学标准的这种重新利用,该应用程序基于复杂的基因组可视化工具自动呈现了交互式数据可视化。我们的工具允许行为科学家以可扩展和灵活的方式共享,显示和浏览包含多个个人和多种数据类型的复杂行为数据。下载选项允许使用基因组工具进行进一步分析。在行为科学正进入数据密集型周期的时代,由于高吞吐量的行为表型平台,服务器可以成为该领域的重要资源。凉亭可在上公开获得。

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