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MetalDetector: a web server for predicting metal-binding sites and disulfide bridges in proteins from sequence

机译:MetalDetector:Web服务器用于根据序列预测蛋白质中的金属结合位点和二硫键

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摘要

>Summary: The web server MetalDetector classifies histidine residues in proteins into one of two states (free or metal bound) and cysteines into one of three states (free, metal bound or disulfide bridged). A decision tree integrates predictions from two previously developed methods (DISULFIND and Metal Ligand Predictor). Cross-validated performance assessment indicates that our server predicts disulfide bonding state at 88.6% precision and 85.1% recall, while it identifies cysteines and histidines in transition metal-binding sites at 79.9% precision and 76.8% recall, and at 60.8% precision and 40.7% recall, respectively.>Availability: Freely available at >Contact: >Supplementary Information: Details and data can be found at
机译:>摘要: Web服务器MetalDetector将蛋白质中的组氨酸残基分类为两种状态(游离或金属结合)之一,半胱氨酸分类为三种状态(游离,金属结合或二硫键桥接)之一。决策树整合了两种先前开发的方法(DISULFIND和金属配体预测器)的预测。交叉验证的性能评估表明,我们的服务器预测二硫键的结合状态准确度为88.6%,召回率为85.1%,同时可以识别过渡金属结合位点中的半胱氨酸和组氨酸,准确度为79.9%和76.8%,准确度为60.8%和40.7。分别具有%的召回率。>可用性:可从>联系人免费获得: >补充信息:详细信息和数据可在以下网站找到

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