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BioRuby: bioinformatics software for the Ruby programming language

机译:BioRuby:用于Ruby编程语言的生物信息学软件

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摘要

>Summary: The BioRuby software toolkit contains a comprehensive set of free development tools and libraries for bioinformatics and molecular biology, written in the Ruby programming language. BioRuby has components for sequence analysis, pathway analysis, protein modelling and phylogenetic analysis; it supports many widely used data formats and provides easy access to databases, external programs and public web services, including BLAST, KEGG, GenBank, MEDLINE and GO. BioRuby comes with a tutorial, documentation and an interactive environment, which can be used in the shell, and in the web browser.>Availability: BioRuby is free and open source software, made available under the Ruby license. BioRuby runs on all platforms that support Ruby, including Linux, Mac OS X and Windows. And, with JRuby, BioRuby runs on the Java Virtual Machine. The source code is available from .>Contact:
机译:>摘要:BioRuby软件工具箱包含一整套免费的开发工具和库,这些工具和库均以Ruby编程语言编写,可用于生物信息学和分子生物学。 BioRuby具有用于序列分析,途径分析,蛋白质建模和系统发育分析的组件;它支持许多广泛使用的数据格式,并可以轻松访问数据库,外部程序和公共Web服务,包括BLAST,KEGG,GenBank,MEDLINE和GO。 BioRuby带有教程,文档和交互式环境,可在外壳程序和Web浏览器中使用。>可用性: BioRuby是免费的开源软件,根据Ruby许可提供。 BioRuby在支持Ruby的所有平台上运行,包括Linux,Mac OS X和Windows。而且,借助JRuby,BioRuby可以在Java虚拟机上运行。可从。>联系人:获得源代码。

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