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OTUbase: an R infrastructure package for operational taxonomic unit data

机译:OTUbase:用于操作分类单位数据的R基础结构软件包

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摘要

>Summary: OTUbase is an R package designed to facilitate the analysis of operational taxonomic unit (OTU) data and sequence classification (taxonomic) data. Currently there are programs that will cluster sequence data into OTUs and/or classify sequence data into known taxonomies. However, there is a need for software that can take the summarized output of these programs and organize it into easily accessed and manipulated formats. OTUbase provides this structure and organization within R, to allow researchers to easily manipulate the data with the rich library of R packages currently available for additional analysis.>Availability: OTUbase is an R package available through Bioconductor. It can be found at >Contact:
机译:>摘要: OTUbase是一个R包,旨在促进对操作分类单位(OTU)数据和序列分类(分类)数据的分析。当前,有一些程序可以将序列数据聚集到OTU中和/或将序列数据分类到已知的分类法中。但是,需要一种可以获取这些程序的摘要输出并将其组织为易于访问和操纵的格式的软件。 OTUbase在R中提供了这种结构和组织,使研究人员可以使用当前可用于其他分析的丰富R包库轻松地处理数据。>可用性: OTUbase是可通过Bioconductor获得的R包。可以在>联系人:中找到

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