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Integrative analysis and variable selection with multiple high-dimensional data sets

机译:具有多个高维数据集的集成分析和变量选择

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摘要

In high-throughput -omics studies, markers identified from analysis of single data sets often suffer from a lack of reproducibility because of sample limitation. A cost-effective remedy is to pool data from multiple comparable studies and conduct integrative analysis. Integrative analysis of multiple -omics data sets is challenging because of the high dimensionality of data and heterogeneity among studies. In this article, for marker selection in integrative analysis of data from multiple heterogeneous studies, we propose a 2-norm group bridge penalization approach. This approach can effectively identify markers with consistent effects across multiple studies and accommodate the heterogeneity among studies. We propose an efficient computational algorithm and establish the asymptotic consistency property. Simulations and applications in cancer profiling studies show satisfactory performance of the proposed approach.
机译:在高通量组学研究中,由于样品的局限性,从单个数据集的分析中鉴定出的标记物常常缺乏可重复性。一种经济有效的补救措施是汇集来自多个可比较研究的数据并进行综合分析。由于数据的高维度和研究之间的异质性,因此多个组学数据集的集成分析具有挑战性。在本文中,为了对来自多个异类研究的数据进行综合分析中的标记选择,我们提出了2范式群桥惩罚方法。这种方法可以有效地识别在多个研究中具有一致作用的标记物,并适应研究之间的异质性。我们提出一种有效的计算算法并建立渐近一致性性质。在癌症概况研究中的仿真和应用显示了所提出方法的令人满意的性能。

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