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Messenger RNA and MicroRNA transcriptomic signatures of cardiometabolic risk factors

机译:代谢风险因素的Messenger Messenger和MicroRNA转录组签名

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摘要

BackgroundCardiometabolic (CM) risk factors are heritable and cluster in individuals. We hypothesized that CM risk factors are associated with multiple shared and unique mRNA and microRNA (miRNA) signatures. We examined associations of mRNA and miRNA levels with 6 CM traits: body mass index, HDL-cholesterol and triglycerides, fasting glucose, and systolic and diastolic blood pressures through cross-sectional analysis of 2812 Framingham Heart Study who had whole blood collection for RNA isolation for mRNA and miRNA expression studies and who consented to genetic research. We excluded participants taking medication for hypertension, dyslipidemia, or diabetes. We measured mRNA (n = 17,318; using the Affymetrix GeneChip Human Exon 1.0 ST Array) and miRNA (n = 315; using qRT-PCR) expression in whole blood. We used linear regression for mRNA analyses and a combination of linear and logistic regression for miRNA analyses. We conducted miRNA-mRNA coexpression and gene ontology enrichment analyses to explore relations between pleiotropic miRNAs, mRNA expression, and CM trait clustering.
机译:背景心脏代谢(CM)危险因素是可遗传的并且聚集在个体中。我们假设CM危险因素与多个共享和独特的mRNA和microRNA(miRNA)签名相关。我们通过2828 Framingham心脏研究的横断面分析检查了mRNA和miRNA水平与6个CM特征之间的关联:体重指数,HDL-胆固醇和甘油三酸酯,空腹血糖以及收缩压和舒张压,该研究收集了全血以进行RNA分离用于mRNA和miRNA表达研究以及同意进行基因研究的人员。我们排除了因高血压,血脂异常或糖尿病而服用药物的参与者。我们测量了全血中的mRNA(n = 17,318;使用Affymetrix GeneChip Human Exon 1.0 ST阵列)和miRNA(n = 315;使用qRT-PCR)。我们使用线性回归进行mRNA分析,并使用线性和逻辑回归进行miRNA分析。我们进行了miRNA-mRNA共表达和基因本体富集分析,以探索多效性miRNA,mRNA表达和CM性状聚类之间的关系。

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