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Identification of potential CepR regulated genes using a cep box motif-based search of the Burkholderia cenocepacia genome

机译:使用基于等概率基盒基序的伯克霍尔德酒新菌基因组搜索来鉴定潜在的受CepR调控的基因

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摘要

BackgroundThe Burkholderia cenocepacia CepIR quorum sensing system has been shown to positively and negatively regulate genes involved in siderophore production, protease expression, motility, biofilm formation and virulence. In this study, two approaches were used to identify genes regulated by the CepIR quorum sensing system. Transposon mutagenesis was used to create lacZ promoter fusions in a cepI mutant that were screened for differential expression in the presence of N-acylhomoserine lactones. A bioinformatics approach was used to screen the B. cenocepacia J2315 genome for CepR binding site motifs.
机译:背景已证明伯克霍尔德菌cenocepacia CepIR群体感应系统可以正向和负向调节与铁载体生成,蛋白酶表达,运动性,生物膜形成和毒力有关的基因。在这项研究中,使用了两种方法来鉴定由CepIR群体感应系统调控的基因。转座子诱变用于在cepI突变体中创建lacZ启动子融合体,并在N-酰基高丝氨酸内酯存在下筛选差异表达。一种生物信息学方法被用来筛选新芽孢杆菌J2315基因组中的CepR结合位点基序。

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