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Counting motifs in dynamic networks

机译:动态网络中的主题计数

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摘要

BackgroundA network motif is a sub-network that occurs frequently in a given network. Detection of such motifs is important since they uncover functions and local properties of the given biological network. Finding motifs is however a computationally challenging task as it requires solving the costly subgraph isomorphism problem. Moreover, the topology of biological networks change over time. These changing networks are called dynamic biological networks. As the network evolves, frequency of each motif in the network also changes. Computing the frequency of a given motif from scratch in a dynamic network as the network topology evolves is infeasible, particularly for large and fast evolving networks.
机译:背景技术网络主题是在给定网络中频繁出现的子网络。这些基序的检测很重要,因为它们揭示了给定生物网络的功能和局部特性。但是,查找主题是一项计算难题,因为它需要解决代价高昂的子图同构问题。此外,生物网络的拓扑随着时间而变化。这些不断变化的网络称为动态生物网络。随着网络的发展,网络中每个主题的频率也会发生变化。随着网络拓扑的发展,从头开始计算动态网络中给定主题的频率是不可行的,尤其是对于大型且快速发展的网络而言。

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