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A comprehensive transcript index of the human genome generated using microarrays and computational approaches

机译:使用微阵列和计算方法生成的人类基因组的综合转录指数

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摘要

BackgroundComputational and microarray-based experimental approaches were used to generate a comprehensive transcript index for the human genome. Oligonucleotide probes designed from approximately 50,000 known and predicted transcript sequences from the human genome were used to survey transcription from a diverse set of 60 tissues and cell lines using ink-jet microarrays. Further, expression activity over at least six conditions was more generally assessed using genomic tiling arrays consisting of probes tiled through a repeat-masked version of the genomic sequence making up chromosomes 20 and 22.
机译:背景技术基于计算和基于微阵列的实验方法被用于生成人类基因组的综合转录指数。从人类基因组中大约50,000个已知和预测的转录序列设计的寡核苷酸探针用于使用喷墨微阵列研究60种不同组织和细胞系的转录。此外,更普遍地使用至少由六种条件组成的基因组平铺阵列评估表达活性,所述基因组平铺阵列由探针组成,这些探针平铺于构成染色体20和22的基因组序列的重复蒙版中。

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