松江鲈鱼野生群体遗传多样性的RAPD分析和SCAR标记的转化

摘要

首先, 从294条10个碱基随机引物中, 筛选出32条多态性引物, 对富春江、黄河、滦河和鸭绿江等4个松江鲈鱼 （Trachidermus fasciatus）野生群体共120尾个体进行RAPD分析。结果表明, 松江鲈鱼野生群体的遗传多样性较丰富，其主要表现在：① 在扩增得到的591个位点中, 有515个（87.14%）位点呈现多态性，群体间多态位点比率（P）的大小顺序为：富春江群体89.17%〉黄河群体87.99%〉鸭绿江群体86.63%〉滦河群体83.25%。② 松江鲈鱼群体间的Shannon信息指数（IT）和Nei’s遗传多样性指数（HT）分别在0.3393~0.3566和0.2157~0.2279间, 滦河群体的值较其他3群体稍低；若作为一个整体, 则总的 Shannon信息指数（IT）和Nei’s遗传多样性指数（HT）分别为0.3710±0.2153和0.2336±0.1643。③ 虽然群体间基因流值（Nm）在5.76103～19.84497间, 显示各地理群体间存在程度不同的基因交流, 但分子方差分析（AMOVA）结果却表明, 各群体间存在显著（P〈0.05）或极显著（P〈0.01）的遗传分化。④ 聚类分析表明, 鸭绿江群体首先与黄河群体聚为一支, 再与富春江群体相聚, 最后与单独一支的滦河群体聚类, 表明鸭绿江、黄河、富春江等3群体间的遗传距离与彼此间的地理距离远近密切相关, 而滦河群体与它们的遗传距离较远。其次, 从获得的S1225525 bp、S1225605 bp、S1225841 bp、S1345695 bp、S1345825 bp 等5个特异RAPD条带中, 成功地由S1225605 bp、S1225841 bp条带分别转化出SCAR01560 bp、SCAR02443 bp的SCAR标记。这两个标记的出现频率, 在鸭绿江群体最高（96.67%和93.33%）、富春江群体其次（83.33%和90%）、黄河群体再其次（56.67%和66.67%）、滦河群体最低（13.33%和20%）。因此, SCAR01560 bp、SCAR02443 bp可作为鉴别松江鲈鱼滦河群体与其他3群体的分子标记。