基于网络药理学和分子对接探讨龟鹿二仙胶治疗少、弱精子症作用机制

摘要

目的基于网络药理学和分子对接探讨龟鹿二仙胶治疗少、弱精子症(AS)的物质基础及作用机制。方法运用TCMSP数据库筛选龟鹿二仙胶中枸杞子、人参的活性成分及靶标,检索文献及BATMAN-TCM、DrugBank、ETCM、化学专业数据库获取鹿角胶、龟板胶活性成分及靶标;运用GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD、DisGeNET数据库筛选AS靶标;运用R语言软件映射得到龟鹿二仙胶治疗AS靶标,运用Cytoscape平台构建龟鹿二仙胶-药物活性成分-靶标及龟鹿二仙胶-药物活性成分-靶标-AS间的互作网络图;运用STRING平台构建治疗靶标间互作网络图;运用ClueGo插件对治疗靶标行GO生物功能分析,R语言软件行KEGG通路富集分析;并运用ZINC、RCSB PDB数据库,AutoDock、PyMOL软件对药物有效活性成分与关键靶标作分子对接。结果从龟鹿二仙胶中共获得83个有效活性成分,得到53个龟鹿二仙胶治疗AS的潜在靶标,这些靶标主要涉及氧化应激、脂质沉积负调节等生物学过程,并主要富集在PI3K/Akt,HIF-1等信号通路上;分子对接验证显示对接得分<-5 kcal·mol^(-1)占82.5%,即大部分靶标与成分的结合活性较好。结论通过网络药理学及分子对接证实了龟鹿二仙胶多成分、多靶标、多途径的作用特点,预测了龟鹿二仙胶可能通过PI3K/Akt,HIF-1等途径,从而调控氧化应激、脂质代谢等生物学过程治疗AS的可能作用机制,为进一步研究其活性成分和作用机制提供理论依据。