一株印度洋深海食烷菌(Alcanivorax sp．P40)的烷烃羟化酶基因的克隆

摘要

以印度洋深层海水,用柴油和石油作为混合碳源经富集培养、分离获得一株具有很强的柴油降解能力的菌株P40.菌株P40革兰氏染色阴性,接触酶和氧化酶为阳性,能还原硝酸盐,不能还原亚硝酸盐.16S rDNA B lastn结果表明其与Alcanivorax dieseloleiB-5T(柴油食烷菌)及A.dieseloleiNO1A具有最高相似性,均为99.8%.菌株P40的gyrB序列与A.dieseloleiNO1A同源性也高达99.2%,而与A.dieseloleiB-5T只有86.9%.此外,从菌株P40中克隆到两个烷烃羟化酶alkB基因片断,分别命名为P40a-lkB1和P40a-lkB2.其中P40a-lkB1与报道的A.dieseloleiB-5T中的alkB同源性较高,达96.3%,而与同为深海来源的菌株NO1A的alkB的同源性更是达100%,P40a-lkB2则与A.borkum ensisSK2T(泊库岛食烷菌)的alkB1同源性最高,但仅为65%.