畜禽粪便中典型抗生素抗性基因的检测和分析

摘要

为研究畜禽粪便中抗生素抗性基因(Antibiotic Resistance Genes,ARGs)污染水平和分布特征,采集26家规模化养殖场畜禽粪便,利用荧光定量PCR技术检测四环素类抗性基因和喹诺酮类抗性基因及表达丰度.结果发现,畜禽粪便中四环素类抗性基因平均检出率为78.2％(61/78),喹诺酮类抗性基因平均检出率为53.8％(28/52).另外,通过QPCR技术对不同养殖场畜禽粪便中ARGs进行绝对定量,并将ARGs的浓度与其内参基因16SrRNA的浓度做归一化处理,得到各ARGs的相对丰度,分析抗生素抗性基因在猪场、鸡(鸭)场和牛(羊)场中相对丰度发现,生猪养殖场抗性基因相对丰度明显高于牛(羊)和鸡(鸭)养殖场.随机选取6家养殖场堆肥粪便与新鲜粪便进行抗性基因含量检测,两者抗性基因表达含量无显著性差异,表明普通粪便处理方式对抗性基因没有明显影响.本研究结果对于掌握畜禽养殖场ARGs污染现状以及评估规模化养殖场耐药基因污染风险,保障动物食品质量安全具有重要意义.