孕中期羊水游离RNA中泌尿系统发育关键基因的筛选与生物学功能分析

摘要

目的筛选并分析孕中期羊水游离RNA(AfcfRNA)中的泌尿系统发育关键基因。方法从GEO数据库获取胎儿AfcfRNA的芯片检测数据。对56例AfcfRNA的芯片检测结果进行基因共表达网络(WGCNA)分析,建立共表达网络模块。从Human Protein Atlas数据库中筛选在泌尿组织中表达量高于平均表达量10倍的基因为泌尿组织特异基因。以泌尿组织特异基因和共表达模块为基础,建立泌尿系统特异基因共表达模块。对泌尿组织特异共表达模块中的基因进行GO分析,阐述其生物学功能。利用STRING数据库进行基因编码蛋白的蛋白-蛋白相互作用网络分析,设定combine_score为150、degree为20,并删除表达量偏低(