单细胞蛋白质组学分析方法的应用进展

摘要

单细胞蛋白质组学分析方法有肽段识别和蛋白质推断、蛋白质丰度定量、蛋白质生物功能分析。从质谱仪中获取单细胞蛋白质裂解谱后,利用单细胞质谱分析工具(MASCOT、Andromeda)识别肽段,推断蛋白质类型。采用毛细管电泳电喷雾电离高分辨率质谱技术可识别单细胞中同位素编码的蛋白质标记,与有标定量软件MaxQuant联合使用,对完整蛋白质组和低丰度蛋白质组的灵敏度和特异度较高。基于质谱的单细胞蛋白质分析软件可用于分析单细胞蛋白质的生物过程、分子功能、细胞成分及相关信号通路。基于质谱定量的MaxQuant数据库可构建蛋白质相互作用网络,分析单细胞蛋白质的生物学功能。