药物分子疏水性质的三维表达——疏水势的定义和计算

摘要

利用疏水作用的实验研究结果和“原子疏水参数”提出了疏水作用势场的计算方法,并据此编写出用于计算药物和受体分子周围疏水势场三维分布的HYPOT程序;利用绘图软件GRAFTOOL或TDISOP可清楚地表达疏水势场的分布情况。对5个典型化合物的计算结果表明:在分子的邻域内疏水势分布不均匀,亲水性分子邻域内可存在疏水区域,反之亦然;距分子较远的地方,亲水性分子的疏水势均为负值,而疏水性分子的疏水势均为正值,证明我们的有关疏水势的定义和计算是合理的。