基于16S Rrna测序比较探讨气虚证患者与健康人的肠道菌群的结构特征

摘要

目的 采用16S rRNA测序技术,检测比较气虚患者和健康人群的肠道菌群多样性、相对丰度及分布的差异.方法 选取在湖北省中医院就诊的气虚证患者20例为观察对象,以及同期健康志愿者10名作为对照.采用粪便基因组DNA提取试剂盒抽提HG和QD粪便样本中DNA,对V3-V4区进行PCR扩增,再进行文库构建和Illumina MiSeq测序.最后对数据进行生物信息学分析,探索气虚证人群肠道菌群的结构组成特征.结果 本研究共得到534个OTU.物种累积曲线表明本研究所收集的样本量充足.HG和QD两组alpha指数不存在明显差异(P>0.05).通过beta多样性分析可见,HG和QD两组肠道菌群构成存在一定差异.此外,QD组的Firmicutes/Bacteroides比值较健康人群升高.相较于HG,g_Odoribacter、蓝藻菌门、g_Anaerotruncus、c_Chloroplast、s_Clostridium_Methylpentosum和o_Streptophyta在QD中显著富集(P<0.05).结论 气虚证患者肠道菌群的组成结构与健康人群存在一定差异.在气虚证的发生发展中,肠道菌群的改变可能起到了重要作用.