基于ITS2的和田玫瑰分子进化分析

摘要

目的:分析和田玫瑰分子系统发育进化式样并评价其道地性。方法:采用聚合酶链式反应获得和田玫瑰内转录间隔区2(ITS2)序列,在美国国家生物技术信息中心数据库(NCBI)比对,从GenBank获取邻近属ITS2序列共52条,利用MEGAX软件进行多重比对分析,构建邻接(NJ)系统发育树,推断进化时间,预测ITS2序列二级结构。结果:基于ITS2引物扩增获得长度为409 bp的序列,包括小亚基核糖体核糖核酸基因和内部转录间隔区的部分序列(1~39 bp)、5.8S核糖体核糖核酸基因全序列(40~64 bp)、ITS2标准全序列(65~268 bp)、大亚基核糖体核糖核酸基因的部分序列(269~409 bp)。分析发现和田玫瑰与英国、意大利等欧洲产玫瑰Rosa sherardii距离最近,共同亲本是大马士革玫瑰,和田玫瑰于20000多年前开始出现。结论:和田玫瑰ITS2标准序列为204 bp,起源于欧洲大马士革玫瑰,分歧进化时间约为29000年,与《中华人民共和国药典》2020年版收录玫瑰花的ITS2序列二级结构的区别主要在Ⅲ螺旋区部位。