深港两地工程土壤细菌多样性的T-RFLP分析

摘要

目的:建立一种高效的末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)方法,检测工程土壤细菌.方法:以深圳和香港两地不同土层(0.5,10,20和30 m)的工程土壤为研究对象,提取并纯化总DNA,利用细菌16S rDNA基因通用引物8f-FAM/1492r进行PCR扩增,扩增产物分别用HhaⅠ、HaeⅢ和Msp Ⅰ限制性内切酶酶切,酶切产物经毛细管电泳测序,序列上传至数据库进行分析.结果:经过比对分析,香港段土壤中大约存在细菌141属,235种;深圳段大约存在132属,206种;32个细菌种属只在香港土壤中有分布,3个细菌种属只在深圳土壤中有分布;植物病原细菌有14个种属.结论:建立的T-RFLP方法能够高效、快速地分析工程土壤细菌.