基于重复-动态博弈模型的可变剪接预测

摘要

人类基因组测序工作初步结果显示,人类基因数量只有大约3.5万个,活细胞使用这些基因来产生更有活力且更加充裕的指示源.可变剪接现象是活细胞具有惊人多样性的很好解释,因此发展生物信息学方法进行可变剪接研究显得尤为重要。本文提出了基于重复-动态博弈的可变剪接预测模型,该模型利用了动态博弈和重复博弈的思想,使用模糊聚类法提取博弈模型的参与人,将自上而下和自下而上相结合,并选择了具有高效率且比较依赖特征选择的朴素贝叶斯作为分类器.实验结果显示,基于重复-动态博弈的可变剪接预测模型具有最高的分类准确率耗时最短、使用的分类次数最少、特征选择机制更加优秀.