下龙湾地区根际土壤可培养原核微生物多样性研究

摘要

[目的]下龙湾位于越南东北部广宁省,属于典型的喀斯特地貌,拥有独特的生态系统,获取其可培养原核微生物并进行多样性分析评价,对获取具有产业化应用前景的微生物资源有重要意义。[方法]本研究基于微生物纯培养技术,以越南下龙湾地区植物根际土壤样本为研究对象,对细菌和放线菌进行分离、纯化,并基于16S rRNA基因测序结果,通过序列比对、系统发育分析和多样性指数分析,对所获纯培养物进行多样性检测。[结果]共获得266个菌株,分属于12个目29个科54个属,Shannon-Wienner生物多样性指数(H′)为6.970,Simpson物种多样性指数(D)为0.987,Shannon物种均匀度指数(E)为1.384,Margalef物种丰富度指数(dMa)为27.40。下龙湾地区根际土壤可培养原核微生物主要为放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria),其中芽孢杆菌属(Bacillus)、假单胞菌属(Pseudomonas)、链霉菌属(Streptomyces)为优势种。潜在新种占4%。[结论]下龙湾地区蕴含丰富的细菌和放线菌资源,可为微生物资源开发利用提供良好的菌种来源。