6株超级细菌NDM-1基因环境研究

摘要

目的：研究6株超级细菌NDM-1基因环境，探讨耐药基因水平转移机制。方法：收集耐碳青霉烯的G-杆菌400株，利用PCR方法检测NDM-1基因，并测序验证。根据目前报道的NDM-1基因环境常见类型设计系列引物，步移法特异性扩增NDM-1基因上下游序列，并对扩增产物测序和序列分析。步移法检测阴性的菌株进行全基因组HindⅢ酶切，将NDM-1基因及基因环境克隆到pET28a质粒后再测序。结果：400株对碳青霉烯类耐药的G-杆菌中有6株NDM-1阳性。步移法检出其中5株菌的基因环境，包括不动杆菌基因种13TU、产酸克雷伯菌、不动杆菌基因种3、肺炎克雷伯菌和阴沟肠杆菌。这5株菌的基因环境与文献报道基本一致。产气肠杆菌的NDM-1基因环境经DNA克隆测序获得，从上游至下游为：部分缺失的转座酶Tn3、IS26及ISAba125，blaNDM-1，ble，部分缺失的异构酶trpF和SSen4元件。结论：NDM-1基因上下游常包含转座子或插入序列等元件，为其水平转移奠定基础。