蔷薇科SSR引物在云南栘木衣中的通用性分析

摘要

【目的】探究蔷薇科植物的SSR引物在云南栘[木衣]中的通用性,以便快速获得在云南栘[木衣]可以通用的SSR标记。【方法】以云南省瑞丽市、梁河县、陇川县和芒市4个天然居群的云南栘[木衣]为试验材料,利用100对李、梨、苹果、枇杷和Malacomeles denticulata等蔷薇科植物的SSR引物对云南栘[木衣]进行PCR扩增,从中筛选出具有多态性的SSR引物,并对云南栘[木衣]进行遗传多样性分析和聚类分析。【结果】在100对蔷薇科植物的SSR引物中有52对SSR引物在云南栘[木衣]中扩增出了目标产物条带,其中有42对SSR引物扩增出多态性条带,多态性引物所占比例为80.77%。4个云南栘[木衣]天然居群的多态位点比例、Shannon’s指数、Nei’s遗传多样性、观测等位基因数和有效等位基因数的均值分别为32.65%,0.1917,0.1311,1.3265和1.2324,其中瑞丽居群的以上多样性指数依次为40%,0.2243,0.1509,1.4000和1.2577,明显高于其他居群,表明其具有较高的遗传多样性,可能具有较为丰富的遗传变异。聚类分析结果表明,4个居群的云南栘[木衣]可分为2大类群,其中瑞丽、陇川和芒市居群聚为一类,梁河居群单独聚为一类,分类结果与地理区域分布情况一致。【结论】蔷薇科植物的SSR引物在云南栘[木衣]中具有较好的通用性,这些SSR为后续云南栘[木衣]及其近缘种进行种质资源鉴定和遗传多样性分析等研究提供了可用的标记。