2021年南通市某养老机构胃肠炎暴发疫情中诺如病毒分子分型分析

摘要

目的:分析2021年南通市某养老机构一起胃肠炎暴发疫情中诺如病毒的分子分型。方法:将收集到的标本采用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)方法检测诺如病毒核酸,阳性标本再进行反转录扩增衣壳区和聚合酶区,扩增产物经凝胶电泳分析后获得特征性条带,对反转录产物进行序列测定,确定基因型,使用MEGA 7.0软件对测序结果进行分析并构建系统发生树。结果:30份肛拭子标本共检出25份诺如病毒,且均为GⅡ,测序成功16株,诺如病毒在线分型工具结果显示为GⅡ.P16-GⅡ.4 Sydney2012和GⅡ.3-GⅡ.P12两种基因型,与MT501844.1(西班牙株)、MT127358.1 GⅡ(韩国株)、MW205667.1(北京株)、MH842259.1(浙江台州株)同源性较高。结论:引起此次胃肠炎事件暴发的是诺如病毒,主要型别为GⅡ.P16-GⅡ.4 Sydney2012和GⅡ.3-GⅡ.P12。