IL-1β、TNF-α和IFN-γ对小鼠胰岛β细胞中lncRNA表达谱的影响

摘要

目的 :探讨及分析细胞因子[白介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和γ-干扰素(IFN-γ)]干预后小鼠胰岛细胞株MIN6中的长链非编码RNA(lnc RNA)表达谱的变化,并进行初步验证。方法:细胞因子干预小鼠胰岛细胞株MIN6,流式细胞仪检测细胞凋亡,CCK-8检测细胞活性,采用Affymetrix Gene Chip Mouse Transcriptome Array 1.0基因芯片筛查细胞因子干预组和正常对照组差异表达的lnc RNA,并采用实时荧光定量PCR对筛选出的部分lnc RNA进行验证。结果:与对照组相比,细胞因子干预组的细胞凋亡增加,细胞活性下降。细胞因子干预组中表达相差2倍以上的lnc RNA有723条,其中表达上调有444条,表达下调有279条。表达相差5倍以上的lnc RNA有111条,其中表达上调有105条,表达下调有6条。表达相差1.5倍以上的m RNA有2 180条。10条lnc RNA在细胞因子干预组中的表达经初步证实,结果与芯片趋势一致。结论:细胞因子干预后小鼠胰岛细胞株MIN6中lnc RNA的表达谱发生了显著变化,这些差异表达的lnc RNA在细胞因子诱导的胰岛细胞凋亡中具有重要作用。