利用KS基因筛选Ⅱ型聚酮类化合物产生菌的方法研究

摘要

根据酮基合酶编码基因（ketoacyl synthase，KS）的同源性设计简并引物，并利用PCR技术快速筛选携带聚酮类化合物编码基因的放线菌菌株．试验筛选了33株放线菌菌株，检测获得PKSⅡ型阳性菌株16株．克隆并测序获得16条KS基因序列，进行BLAST同源性比对，与GenBank中已知的KS基因序列的相似度在89％～99％之间．提交GenBank，获得的各菌株KS基因登录号为FJ620885～FJ620889，FJ620892，FJ878801～FJ878810．抑菌实验表明，携带KS基因的16株放线菌中，13株具有抑制真菌活性，2株具有抑制革兰氏阳性细菌活性．系统进化树分析表明16株放线菌可以分为7个类群，其中，具有产生新獭聚酮类化合物潜力的菌株8株，说明筛选出的KS基因具有一定的多样性．结果表明，利用PCR技术可以快速有效筛选Ⅱ型KS基因，为生物资源的开发利用莫定基础．