Genome-wide Analysis of Kelch Repeatcontaining F-box Family

摘要

ubiquitin 依赖的蛋白质降级小径在优核质起多样的作用。以前的研究显示 F 盒子和 Kelch 主题在许多有机体是普通的。F 盒子蛋白质是建筑群把 SCF (SKP1， Cullin1， F 盒子蛋白质，和 Rbx1 ) 称为的 E3 ubiquitin 连接酶的子单元；他们有绑在 SKP1 (S 阶段 kinaseassociated 蛋白质) 的一个 N 终端 F 盒子主题，并且经常有 C 终端蛋白质蛋白质相互作用领域，它经由 ubiquitin 小径为降级指定蛋白质底层。经常在 F 盒子蛋白质发现蛋白质相互作用领域的大多数之一是 Kelch 重复领域。尽管 F-boxand Kelch 重复是古老的主题， Kelch 包含重复的 F 盒子蛋白质(KFB ) 仅仅以前为人和 Arabidopsis 被报导了。米饭染色体和另外的植物染色体的最近的定序提供一个机会检验 KFB 的可能的进化历史。我们执行了广泛的强风搜索在选择有机体识别通常认为的 KFB，并且分析了他们的关系种系发生的联盟者。我们也在米饭和 Arabidopsis 执行了基因复制和 KFB 的基因表示的分析。在动物和植物的分叉，和植物 KFB 经历了快速的基因复制以前，我们的学习显示 KFB 的起源发生……