添加能量和倾向性因子识别蛋白质——金属离子配体结合残基

摘要

金属离子作为一种重要的配体与蛋白质结合在细胞代谢、物质运输和信号传导等过程中发挥着重要作用。因此,理论上准确识别蛋白质与金属离子配体结合残基有十分重要的意义。选取10种金属离子配体作为研究对象,以氨基酸、氨基酸的物化特征和预测的结构信息作为基础特征参数,添加能量和倾向性因子两种新的预测参数,使用支持向量机(SVM)算法对蛋白质-金属离子配体结合残基进行预测,五交叉检验和独立检验都得到了较好的预测结果,独立检验下Fe^(2+)、Fe^(3+)、Co^(2+)和K^(+)得到了好于前人的预测结果。