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基因组中“k字”频数的分布

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摘要

寻找物种基因组中k-mer频数分布的特征,对大肠杆菌、枯草杆菌、甲烷球菌、疟原虫(部分)等四个典型物种的基因组全序列进行了统计分析.引入"字"域、"频数"域的信息熵,并研究这两种信息熵与变量k之间的关系.发现它们之间具有很好的线性关系,并且"频数"域的信息熵与k的线性关系在物种间具有普适性.

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来源
《内蒙古大学学报：自然科学版》 |2005年第3期|301-305|共5页
作者
贾晓超; 李培芳; 罗辽复;
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作者单位

内蒙古大学理工学院物理系;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类理论生物物理学;
关键词
基因组; k-mer; 频数; 信息熵;

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