钠离子对poly(dT)·poly(dA)·poly(dT)三螺旋DNA分子呼吸模式的影响

摘要

利用分子结构的螺旋对称性,建立了一个包括钠离子的三链DNA 分子poly(dT) *poly(dA)*poly(dT)的晶格动力学模型,计算了poly(dT)*poly(dA)*poly(dT)的氢键呼吸模式.结果发现钠离子的加入明显地淬灭了位于较低频率的几个最为强烈的Hoogensteen 氢键呼吸模式,而对Watson-Crick氢键呼吸模式影响不明显,这说明钠离子能提高poly(dT )*poly(dA)*poly(dT)三螺旋结构的稳定性.该计算结果很好地解释了poly(dT)*poly(dA )*poly(dT)的热融化实验.