鸡STAT家族成员鉴定及生物信息学分析

摘要

为了揭示鸡STAT基因家族的生物学功能,利用在线网站和软件对鸡STAT家族成员进行了鉴定并从理化性质、基因结构、进化关系、染色体定位及二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明,鸡STAT基因家族有5个成员,分别命名为ChSTAT1,ChSTAT2,ChSTAT3,ChSTAT4,ChSTAT5A。它们都是酸性、不稳定的亲水蛋白,分布在7,27,33等3条染色体上。根据多物种STAT蛋白进化树分析该基因分为5个亚家族,分别含有1个STAT基因,不同亚家族基因结构、蛋白保守结构域均有差异,分支较近的成员间相似性较强。二级结构预测显示,成员均含有α-螺旋、β-折叠、延伸链和无规则卷曲。鉴定出鸡STAT家族包含5个成员,且成员间结构相对较为保守。