RNA测序探讨COPD患者外周血单个核细胞环状RNA表达差异

摘要

目的:通过RNA测序技术检测慢性阻塞性肺疾病(COPD)差异环状RNA并阐述其可能的功能与调控机制.方法:分别采集5例COPD患者与5名正常人外周血,分离单个核细胞,进行去线性化得到环状RNA,并建库测序,以变化倍数Foldchange绝对值≥2且P<0.05统计分析差异环状RNA,并通过来源基因功能与信号通路聚类分析环状RNA可能的功能与通路.结果:测序鉴定到1215个环状RNA,具有显著差异的环状RNA共计187个,其中上调107个,下调80个;环状RNA来源基因功能富集最明显的功能是:细胞过程、细胞与结合.环状RNA来源基因变化最明显的前3个通路分别是:非同源末端连接通路、铁死亡通路与FoxO信号通路.结论:RNA测序发现了COPD中显著变化的环状RNA,以及环状RNA可能调控的功能与通路,为从环状RNA这个新角度理解COPD的发病机制提供理论依据.