Cloning and sequence analysis of atom gene from Sclerotimia sclerotiorum

摘要

arom 基因被反的 PCR 从 Scleortinia sclerotiorum 的 genomic 脱氧核糖核酸克隆。S 的进化关系。在 arom 基因的 sclerotiorum 和其它真菌我们再学习。结果出现了从 5 的 arom 基因。sclerotiorum 让一个单身者打开 4 773 bp 的读的框架并且不包括任何 introns。导出的氨基酸顺序由 1 590residues 组成，并且它对蛋白质到目前为止学习了的所有真菌的 AROM 相应。理论等电点(pI ) 和分子量(Mw ) 分别地是 6.5 和 172.66 kD。arom 基因的 GC 百分比是 44.94。根据从 CDD 和 Prosite 数据库寻找的结果， S 的 AROMprotein。sclerotiorum 包含五保存领域：3-dehydroquinate synthase 领域， 3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase ) 领域， shikimate 5 脱氢酶领域， shikimatekinase 领域，和 -enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase (EPSP sythase ) 领域，和四个主题：二 EPSP synthase 签名， dehydroquinase 一级活跃地点， shikimate kinasesignature。根据 PIR 地点规则 PIRSR000514-1，四机能上地重要的氨基酸残余被排列发现。通常认为的 TATA 盒子和 CAAT 盒子在 5' 在 -23 和 -77loci 独立定位在下游的 arom 基因发现的未翻译的区域，和二 loci 是 likelypolyadenylation 信号。另外， arom 基因的发展史被分析。