基于数据仓库的病毒序列集成数据库系统研究

摘要

目前国际上病毒序列数据库存在分散分布、异构等弊端，这在一定程度上降低了这些序列信息的可用性。此外，只有少数的生物数据库由国内开发和维护。针对绝大多数的病毒，提出了一个病毒序列数据集成系统框架。该框架引入数据仓库集成思想，包括数据源层、数据抽取层、数据集成层和Web应用层等四个层次。该文以流感病毒为例，详细介绍了一个基于该框架的流感病毒序列集成数据库原型FLUDW的实现过程。该系统框架可作为建立其它病毒序列数据库的模板。